De Stichting Vrienden van de Weesper Synagoge is opgericht in 1996 door ds Dick Pruiksma die niet wilde dat het gebouw verkocht zou worden aan een Weesper winkelier. Hij vroeg aandacht voor deze verkoop in de media en een groep regionale bewoners besloot om te proberen het gebouw te kopen. Dat lukte de Stichting Weesper Synagoge. Zij stelde de voorwaarde dat er een aparte stichting voor de exploitatie zou worden opgericht en dat werd de Stichting Vrienden van de Weesper Synagoge. Eerste voorzitter was Dick Pruiksma.

De stichting draagt jaarlijks een bedrag over aan de eigenaar ten behoeve van het onderhoud.

De stichting ontving in 2016 de culturele ANBI-status. Wij publiceren alle ANBI informatie hier op de site.